Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpusd2Q149F1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpusd2Q149F1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpusd2Q149F1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpusd2Q149F1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms