Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp8b1Q148W0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b1Q148W0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms