Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gli2Q0VGT2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gli2Q0VGT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gli2Q0VGT2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gli2Q0VGT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gli2Q0VGT2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms