Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hif3aQ0VBL6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hif3aQ0VBL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms