Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab42Q0PD08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab42Q0PD08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms