Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrioQ0KL02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms