Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2bQ0KL01 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms