Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Plac8l1Q08EJ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Plac8l1Q08EJ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plac8l1Q08EJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms