Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700061G19RikQ08EE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700061G19RikQ08EE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms