Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cass4Q08EC4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cass4Q08EC4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms