Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssrp1Q08943 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms