Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc4Q08624 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc4Q08624 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc4Q08624 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc4Q08624 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc4Q08624 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc4Q08624 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc4Q08624 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms