Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb2Q08331 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb2Q08331 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb2Q08331 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms