Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx4Q07424 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx4Q07424 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms