Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn2Q06180 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn2Q06180 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn2Q06180 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms