Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dnal1Q05A62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnal1Q05A62 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnal1Q05A62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms