Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thbs3Q05895 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms