Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnb1Q03717 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnb1Q03717 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms