Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tff2Q03404 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tff2Q03404 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tff2Q03404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tff2Q03404 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms