Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NfiaQ02780 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfiaQ02780 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms