Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb4Q02738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb4Q02738 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb4Q02738 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb4Q02738 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms