Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Muc1Q02496 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Muc1Q02496 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Muc1Q02496 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Muc1Q02496 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Muc1Q02496 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Muc1Q02496 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Muc1Q02496 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Muc1Q02496 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms