Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnnb1Q02248 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnb1Q02248 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms