Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mc1rQ01727 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mc1rQ01727 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mc1rQ01727 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms