Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Top2aQ01320 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2aQ01320 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms