Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Grin2bQ01097 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Grin2bQ01097 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Grin2bQ01097 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Grin2bQ01097 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Grin2bQ01097 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms