Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col8a1Q00780 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col8a1Q00780 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms