Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfaQ00731 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms