Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga4Q00651 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms