Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6stQ00560 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6stQ00560 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms