Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf7Q00417 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf7Q00417 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf7Q00417 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf7Q00417 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf7Q00417 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf7Q00417 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms