Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax8Q00288 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pax8Q00288 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms