Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfcP97953 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfcP97953 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfcP97953 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfcP97953 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfcP97953 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfcP97953 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VegfcP97953 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfcP97953 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfcP97953 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfcP97953 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VegfcP97953 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VegfcP97953 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfcP97953 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfcP97953 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfcP97953 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VegfcP97953 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfcP97953 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfcP97953 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VegfcP97953 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VegfcP97953 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms