Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lama4P97927 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama4P97927 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lama4P97927 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lama4P97927 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lama4P97927 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama4P97927 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms