Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cry1P97784 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cry1P97784 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cry1P97784 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cry1P97784 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cry1P97784 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cry1P97784 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms