Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms