Protein–RNA interactions for Protein: P97369

Ncf4, Neutrophil cytosol factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf4P97369 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncf4P97369 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncf4P97369 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf4P97369 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf4P97369 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf4P97369 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms