Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhodP97348 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhodP97348 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhodP97348 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhodP97348 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhodP97348 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhodP97348 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhodP97348 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhodP97348 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhodP97348 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhodP97348 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhodP97348 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhodP97348 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhodP97348 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhodP97348 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms