Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrp1P97333 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrp1P97333 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms