Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkdcP97313 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkdcP97313 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkdcP97313 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkdcP97313 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkdcP97313 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkdcP97313 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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