Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mesp1P97309 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms