Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb2P81117 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb2P81117 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nucb2P81117 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nucb2P81117 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nucb2P81117 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nucb2P81117 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms