Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprn2P80560 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptprn2P80560 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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