Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb6P70689 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb6P70689 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb6P70689 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms