Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeboxP70368 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms