Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms