Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp4P70343 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp4P70343 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms