Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf6P70279 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf6P70279 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf6P70279 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf6P70279 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf6P70279 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms