Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chl1P70232 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chl1P70232 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chl1P70232 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms