Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd13P70217 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd13P70217 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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